A FMA vem atuando em Emergências Ambientais desde 2011 quando iniciou o processo de capacitação da sua equipe  e adequação das sua infraestrutura para o atendimento de fauna oleada.

Desde então vem desenvolvendo projetos que envolvem, monitoramento em terra, aéreo e embarcado, afugentamento de fauna aquática, resgate, despetrolização, reabilitação e soltura de animais oleados. Análises pós-mortem de individuos acometidos durante os episódios de vazamentos de substâncias derivadas de óleo. 

 Em 2018 começou a construção do seu próprio Centro de Reabilitação e Despetrolização de Fauna Silvestre, localizado em São Cristóvão/SE. Foi inaugurado em 2019, durante o derramamento de óleo que acometeu a costa brasileira, teve uma atuação diferenciada tendo sido responsável pelo resgate, reabilitação e soltura da fauna oleada nos estados de Alagoas, Sergipe e norte da Bahia.

Fotos: Acervo FMA